Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TrioQ0KL02 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms