Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700061G19RikQ08EE8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms