Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cass4Q08EC4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cass4Q08EC4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cass4Q08EC4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cass4Q08EC4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cass4Q08EC4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cass4Q08EC4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cass4Q08EC4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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