Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MitfQ08874 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MitfQ08874 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms