Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbp2Q08652 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbp2Q08652 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms