Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgm3Q08189 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms