Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms