Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nfe2Q07279 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nfe2Q07279 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms