Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox4Q06831 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms