Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdr16c6Q05A13 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdr16c6Q05A13 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms