Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox13Q04891 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms