Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox8Q04886 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox8Q04886 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms