Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scg2Q03517 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scg2Q03517 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms