Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff2Q03404 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms