Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl7Q03366 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms