Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a2Q02788 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a2Q02788 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms