Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfiaQ02780 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms