Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nhlh1Q02576 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms