Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnnb1Q02248 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnnb1Q02248 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms