Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcd1Q02242 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms