Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcqQ02111 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms