Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba1Q02053 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms