Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VcpQ01853 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VcpQ01853 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VcpQ01853 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms