Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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