Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme2Q01768 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms