Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pde1bQ01065 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms