Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms