Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga4Q00651 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms