Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa1Q00623 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoa1Q00623 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoa1Q00623 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms