Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms