Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VldlrP98156 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VldlrP98156 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VldlrP98156 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VldlrP98156 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VldlrP98156 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms