Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn1bP97952 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms