Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
rp9P97762 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
rp9P97762 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
rp9P97762 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
rp9P97762 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
rp9P97762 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
rp9P97762 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
rp9P97762 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
rp9P97762 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
rp9P97762 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms