Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cmklr1P97468 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cmklr1P97468 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cmklr1P97468 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cmklr1P97468 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cmklr1P97468 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cmklr1P97468 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cmklr1P97468 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmklr1P97468 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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