Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bop1P97452 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms