Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frg1P97376 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frg1P97376 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frg1P97376 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms