Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RptnP97347 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RptnP97347 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RptnP97347 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RptnP97347 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RptnP97347 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RptnP97347 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RptnP97347 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RptnP97347 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RptnP97347 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RptnP97347 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RptnP97347 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RptnP97347 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RptnP97347 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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