Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgcdP82347 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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