Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx3P81067 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms