Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gfi1P70338 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1P70338 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1P70338 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1P70338 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1P70338 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1P70338 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1P70338 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1P70338 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gfi1P70338 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gfi1P70338 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gfi1P70338 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gfi1P70338 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms