Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pitx1P70314 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms