Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cux2P70298 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cux2P70298 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux2P70298 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux2P70298 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms