Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Traf6P70196 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf6P70196 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms