Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrig1P70193 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrig1P70193 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms