Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf5P70191 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Traf5P70191 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.1 ms