Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb4bP68372 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb4bP68372 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms