Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rps17P63276 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps17P63276 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms