Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabrb3P63080 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms