Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d2P62838 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms