Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga11P61622 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms